MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 megaplasmid

Total Repeats: 31587

< Previous12...52535455565758596061626364Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_012811	GCC	2	6	1258164	1258169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142935
31502	NC_012811	CGA	2	6	1258229	1258234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142935
31503	NC_012811	CGC	2	6	1258286	1258291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142935
31504	NC_012811	CCA	2	6	1258348	1258353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240142935
31505	NC_012811	CGA	2	6	1258355	1258360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142935
31506	NC_012811	CTTC	2	8	1258367	1258374	0 %	50 %	0 %	50 %	240142935
31507	NC_012811	CGG	2	6	1258387	1258392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142935
31508	NC_012811	CGG	2	6	1258438	1258443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142935
31509	NC_012811	CG	3	6	1258464	1258469	0 %	0 %	50 %	50 %	240142935
31510	NC_012811	CGC	2	6	1258502	1258507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142935
31511	NC_012811	CGCGT	2	10	1258572	1258581	0 %	20 %	40 %	40 %	240142935
31512	NC_012811	CTGC	2	8	1258614	1258621	0 %	25 %	25 %	50 %	240142935
31513	NC_012811	GCC	2	6	1258674	1258679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142935
31514	NC_012811	AGG	2	6	1258702	1258707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142935
31515	NC_012811	GCC	2	6	1258720	1258725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142935
31516	NC_012811	GAT	2	6	1258731	1258736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240142935
31517	NC_012811	GA	3	6	1258759	1258764	50 %	0 %	50 %	0 %	240142935
31518	NC_012811	GC	4	8	1258868	1258875	0 %	0 %	50 %	50 %	240142935
31519	NC_012811	TCG	2	6	1258878	1258883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142935
31520	NC_012811	CG	3	6	1258899	1258904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31521	NC_012811	CGG	3	9	1258967	1258975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31522	NC_012811	GCG	2	6	1259033	1259038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142936
31523	NC_012811	CGG	2	6	1259050	1259055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142936
31524	NC_012811	GGC	2	6	1259075	1259080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142936
31525	NC_012811	GC	3	6	1259092	1259097	0 %	0 %	50 %	50 %	240142936
31526	NC_012811	CGG	2	6	1259114	1259119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142936
31527	NC_012811	GCC	2	6	1259135	1259140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142936
31528	NC_012811	CGGC	2	8	1259152	1259159	0 %	0 %	50 %	50 %	240142936
31529	NC_012811	GCG	2	6	1259191	1259196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142936
31530	NC_012811	CGG	2	6	1259260	1259265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142936
31531	NC_012811	CTT	2	6	1259279	1259284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240142936
31532	NC_012811	GGT	2	6	1259330	1259335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240142936
31533	NC_012811	CGG	2	6	1259374	1259379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142936
31534	NC_012811	CGA	2	6	1259440	1259445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142936
31535	NC_012811	GTA	2	6	1259474	1259479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240142936
31536	NC_012811	CGC	2	6	1259567	1259572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142936
31537	NC_012811	TCG	2	6	1259574	1259579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142936
31538	NC_012811	GCG	2	6	1259619	1259624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142936
31539	NC_012811	CG	4	8	1259632	1259639	0 %	0 %	50 %	50 %	240142936
31540	NC_012811	CGGA	2	8	1259662	1259669	25 %	0 %	50 %	25 %	240142936
31541	NC_012811	GGATC	2	10	1259677	1259686	20 %	20 %	40 %	20 %	240142936
31542	NC_012811	GCC	2	6	1259722	1259727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31543	NC_012811	GCG	2	6	1259740	1259745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31544	NC_012811	ACG	2	6	1259800	1259805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142937
31545	NC_012811	GC	3	6	1259816	1259821	0 %	0 %	50 %	50 %	240142937
31546	NC_012811	CAG	2	6	1259830	1259835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142937
31547	NC_012811	GGC	2	6	1259843	1259848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142937
31548	NC_012811	GCC	3	9	1259868	1259876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142937
31549	NC_012811	AGG	2	6	1259884	1259889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142937
31550	NC_012811	TCGG	2	8	1259953	1259960	0 %	25 %	50 %	25 %	240142937
31551	NC_012811	CGA	2	6	1260020	1260025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142937
31552	NC_012811	CT	3	6	1260045	1260050	0 %	50 %	0 %	50 %	240142937
31553	NC_012811	CAG	2	6	1260110	1260115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142938
31554	NC_012811	GCA	3	9	1260133	1260141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240142938
31555	NC_012811	TCG	2	6	1260186	1260191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142938
31556	NC_012811	GAG	2	6	1260197	1260202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240142938
31557	NC_012811	GGC	2	6	1260212	1260217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240142938
31558	NC_012811	CTC	2	6	1260218	1260223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142938
31559	NC_012811	GCT	2	6	1260319	1260324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240142938
31560	NC_012811	TCC	2	6	1260327	1260332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240142938
31561	NC_012811	AGGC	2	8	1260345	1260352	25 %	0 %	50 %	25 %	240142938
31562	NC_012811	GAGC	2	8	1260454	1260461	25 %	0 %	50 %	25 %	240142938
31563	NC_012811	GCC	2	6	1260510	1260515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240142938
31564	NC_012811	AGA	2	6	1260577	1260582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31565	NC_012811	TTCC	2	8	1260598	1260605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31566	NC_012811	ATCG	2	8	1260692	1260699	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31567	NC_012811	GGCG	2	8	1260734	1260741	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31568	NC_012811	GCG	2	6	1260752	1260757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31569	NC_012811	CGA	2	6	1260798	1260803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31570	NC_012811	CAC	2	6	1260822	1260827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31571	NC_012811	CGG	3	9	1260848	1260856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31572	NC_012811	GGC	2	6	1260916	1260921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31573	NC_012811	CGGCG	2	10	1260942	1260951	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
31574	NC_012811	TCG	2	6	1260953	1260958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31575	NC_012811	GCTG	2	8	1261016	1261023	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31576	NC_012811	CG	3	6	1261072	1261077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31577	NC_012811	CGG	2	6	1261082	1261087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31578	NC_012811	CGC	2	6	1261108	1261113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31579	NC_012811	CCT	2	6	1261203	1261208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31580	NC_012811	CGGCCG	2	12	1261215	1261226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31581	NC_012811	TCG	2	6	1261268	1261273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31582	NC_012811	CGC	2	6	1261289	1261294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31583	NC_012811	CCG	2	6	1261316	1261321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31584	NC_012811	TGC	2	6	1261343	1261348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31585	NC_012811	GCC	2	6	1261384	1261389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31586	NC_012811	CGC	2	6	1261404	1261409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31587	NC_012811	G	6	6	1261416	1261421	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...52535455565758596061626364Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.